一是溯源上的差别

校准实验室所进行的校准和测量应可溯源到国际单位制(SI)，对不能严格按照SI单位进行溯源的，应通过建立对适当测量标准的溯源来提供测量的可信度。对检测实验室，可以依据设备校准分量对总的不确定度贡献的大小来衡量设备的校准溯源要求。当检测设备校准的不确定度分量对检测结果的总的不确定度的贡献不能忽略时，应遵循校准实验室的规定，确保提供所用设备所需的测量不确定度。

二是分包上的差别

检测实验室在向客户出具检测报告时，只需在检测报告中注明某项数据由某分包机构检出，分包方的检测报告不交付客户，而是由发包方保存，最终客户得到的是一张证书/报告。而校准不同，校准实验室不保存分包方的证书/报告，必须将分包方提供的校准证书/报告交付客户，这样客户得到的是两份证书/报告。

三是对测量设备的要求不同

由于校准实验室和检测实验室在溯源等级图中的地位不同，校准用测量设备是承担量值传递的社会公用计量标准的组成部分，因此校准实验室对测量设备的控制更为严格，如《认可准则》规定了校准实验室应对实验室的参考标准、基准、传递标准或工作标准以及标准物质进行核查。

四是证书/报告上的差别。