目前，阿勒泰地区常见的辣椒病害主要有病毒病、炭疽病、灰霉病、白粉病、日烧病(又叫日伤病)、细菌性斑点病(又叫疮痂病)、疫病等。但分布广、为害重、影响大的病害主要有细菌性斑点病和疫病，现将其发病规律及综合防治措施介绍如下：
1、两种主要病害的病原与发病规律
1．1 辣椒细菌性斑点病的病原与发病规律
辣椒细菌性斑点病的病原菌属细菌黄单胞杆菌属。能侵染辣椒、番茄、黄花、烟草、马铃薯、枸杞等植物。
病原菌在种子和病残体上越冬进行初次传播，每次从气孔、伤口，害虫食痕等处侵入，随风雨、灌溉水、混虫、农事操作和植株间相互接触传播，每年可多次侵染。早期田间如有10％病株，就足以导致全田发病，病重时可造成早期大量落叶、落花和落果，对产量影响极大。
此病高温、高湿发病严重。发病适温为25--30℃，在7--8月份高温、多雨季节，特别是在暴风雨后，病害大发生，低洼、密植、土壤偏酸性、管理粗放的辣田发病重。
1．2 辣椒疫病的病原及发病规律
辣椒疫病的病原菌属鞭毛菌亚门、疫霉属的一种病原真菌。此病寄主范围较广，除辣椒外，还可以危害番茄、茄子、黄瓜、南瓜等。病原菌在土壤中和病残体上越冬，随水流或雨滴飞溅进行传播与侵染。地势低洼、土壤黏重、长期积水的田块发病重，降水多的年份或雨后高温发病重，连作地块发病重。
2、综合防治措施
辣椒细菌性斑点病和辣椒疫病两种病害的病原菌发病规律应贯彻以预防为主，综合防治的植保方针，因地制宜采用以农业防治为主的综合防治措施进行防治。
2．1 选育和种植抗病品种，建立无病种子田。
2．2 种子处理
针对细菌性斑点病的种子带菌特点用55℃温水浸种10分钟，然后移入冷水中，催芽播种。或用1：10农用链霉素浸种30分钟后洗净，催芽播种。
2．3 合理的轮作倒茬，与非茄科类蔬菜轮作2--3年。
2．4 选取用无菌土育苗，保证幼苗无病，健壮，对苗床土用福尔马林300倍液，或用农用链霉素3000--4000倍液或杀毒矾500--800倍液等进行床土消毒。
2．5 精细整地，高垅(高畦)、高栽
辣椒田块应强调秋深翻、冬灌，促使病残体分解，加速病菌死亡。同时要求土地平整，修高垅，严禁在高低不平的地块上栽植，在保证成活的情况下，尽量高栽，使用其根茎部处于水位线以上，坡度大的地块，只要缩短毛渠间距，则有减轻病害的作用。
2．6 合理灌水，采用沟灌，严禁大水漫灌和串灌，同时也严禁中量雨前后灌水，一般以早晚灌水为宜，中午因水土温差过大，浇水会降低辣椒的抗病性。
2．7 药剂防治
田间发现中心病株时开始施药，对辣椒细菌性斑点病害，可选用硫酸链霉素3000--4000
倍液，或77％的可杀得可湿性粉剂400倍液或用1：1：200波尔多液或DT可湿性粉剂800倍液进行叶面喷施，每7--10天1次，连喷2--3次。对辣椒疫病，可选用25％的甲霜灵或58％甲霜灵锰锌可湿性粉剂600倍液，或64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液或40％乙磷铝锰锌可湿性粉剂500--800倍液灌根或茎叶喷雾，每7--10天1次，连防2--3次，即可有效地控制辣椒疫病的发生。
