在水稻的优化配方施肥中，人们往往十分重视氮、磷、钾等大量元素化肥的配合施用，却忽略了硅、锌等元素的施用。
事实上，水稻是吸收硅较多的作物，一般茎叶中含有二氧化硅10%~20%，水稻体内硅酸含量约为氮的10倍，磷的20倍左右。水稻缺硅，容易导致茎秆细长软弱，易倒伏和感染病害，前期缺硅使水稻成穗数减少，后期缺硅则小穗数减少，水稻的优质高产就没有保障。水稻施用硅肥，能增强水稻对病虫害的抵抗能力和抗倒伏能力，改善株型，提高光能利用率，减少叶面蒸腾失水，提高水分利用率。一般可增产10%以上，并能提高稻米品质。特别是在新改水田、冷浸田以及酸性土壤上，水稻施用硅肥的效果更为明显。
锌虽然仅仅只是一种微量元素，但对水稻、玉米等喜锌作物作用很大，增产效果很好。水稻对锌元素非常敏感，缺锌会导致植株出叶缓慢，新叶短而窄小，叶色较淡，特别是基部中脉附近褪成黄白色，严重的植株明显矮化丛生，很少分蘖，田间常表现参差不齐，稻株根系老朽，呈褐色，抽穗期出现“扬花不收”，一般减产1~3成，严重田块甚至毁苗绝收。大面积实验结果表明，合理施锌后，水稻株高、有效分蘖数、每穗粒数、千粒重都有增加，空秕率有所降低，一般可增产15%以上。特别是在酸性土壤、石灰性土壤以及冷浸田、新改水田施用锌肥作用则更为明显。
具体施用方法是：（1）硅肥施用。多利用含有钙、镁的硅酸盐作硅肥，在施用基肥时与其它肥料混合施入，每亩施用量为有效硅1公斤。（2）锌用施用。一般提倡作基肥施用，亩施硫酸锌1公斤，与其它化肥混合施入；也可作根外施肥、中后期土壤追肥及种子处理等。根外追肥常用浓度为0.3%硫酸锌，后期追肥为施硫酸锌0.5公斤左右，都在缺锌症状出现后或分蘖末期进行，种子处理则用0.1%硫酸锌浸稻种24小时即可。