货物由发货人托运开始至收货人提取货物为止，几种主要海运单证及其流转程序如下：
1． 装船单证（由托运人办理）
托运人填制托运联单（包括托运单、装货单、收货单等）后，向承运人的代理人办理托运，代理人接受承运后，将承运的船名填入联单内，留存托运单，其它联退还托运人，托运人凭以到海关办理出口报关手续；海关同意放行后，即在装货单上盖放行章，托运人凭以向港口仓库发货或直接装船；然后将装、收货单送交理货公司，船舶抵港后，凭此理货装船，每票货物都装上船后，大副留存装货单，签署收货单；理货公司将收货单退还托运人，托运人凭收货单向代理人换取提单，托运人凭提单等到银行办理结汇，并将提单寄交收货人。
承运人办理的装船单证：
承运人的代理人依据托运单填制装货清单和载货清单，根据承运人的要求，依据装货清单编制货物积载图，船舶抵港后，送大副审核签字后，船方留存一份，提供给代理人若干份，转寄承运人的卸货港代理人；编制分舱单；代理人根据装船实际情况，修编载货清单，经大副签字后，向海关办理船舶离境手续；依据载货清单填制运费清单，寄往承运人的卸货港代理人和船公司。
2． 卸船单证（由收货人办理）
收货人收到正本提单后，向承运人的代理人换取提货单；代理人签发提货单后，须保持正本提单、舱单和提货单内容相一致；收货人凭提货单向海关办理放行手续后，再到港口仓库或船边提取货物；货物提清后，提货单留存港口仓库备查；收货人实收货物少于提单或发生残损时，须索取货物溢短单或货物残损单，并凭以通过代理人向承运人索赔。
承运人办理的卸船单证：
承运人的代理收到舱单、货物积载图、分舱单后向海关办理船舶载货入境手续，并向收货人发出到货通知书，同时将上述单证分送港口、理货等单位；船舶抵港后，理货公司凭舱单理货，凭货物积载图指导卸货，当货物发生溢短或原残时，编制货物溢短单或货物残损单，经大副签认后，提供有关单位。
3． 装、卸船货运单证的流转程序
托运人向代理公司办理货物托运手续：
1 代理公司同意承运后，签发装货单（S/O ），并要求托运人将货物送至指定的装船地点。
2 托运人持代理公司签发的装货单和二联（收货单） 送海关办理出口报关手续。然后，装货单和收货单送交理货公司。
3 代理公司根据S/O留底编制装货清单（L/L） 送船舶。
4 船上大副根据L/L 编制货物配载图（C/P ）交代理公司分送理货、装卸公司等按计划装船。
5 托运人将货物送码头仓库，期间商检和海关到港口检验、验关。
6 货物装船后，理货组长将S/O和收货单（M/R 交大副核对无误后），留下S/O ，签发收货单。
7 理货组长将大副签发的M/R交托运人。
8 托运人持M/R到代理公司处支付运费（在预付运费情况下） 提取提单（B/L） 。
9 代理公司审核无误后，留下M/R，签发B/L给托运人。
10 托运人持B/L到议付银行结汇，议付银行将B/L邮寄开证银行。
11 代理公司编制出口载货清单（M/F） ，向海关办理船舶出口手续，并将M/F交船随带。
12 代理公司根据B/L 副本编制出口载货运费清单（F/M） ，连同B/L 副本送交船公司，并邮寄或交船带交卸货港的代理公司。
13 卸货港的代理公司接到船舶抵港电报后，通知收货人船舶到港日期。
14 收货人到银行付清货款，取回B/L 。
15 卸货港代理公司根据装货港代理公司寄来的货运单证，编制进口载货清单等卸货单据，约定装卸公司，联系泊位，做16 好卸货准备工作。
17 卸货港代理公司办理船舶进口报关手续。
18 收货人向卸货港代理公司付清应付费用后，以正本提单换取提货单（D/O ）。
19 收货人持D/O 送海关办理进口报关手续。
20 收货人持D/O 到码头仓库提取货物。