抗菌药是一把双刃剑，在治疗疾病的同时，如果不正确使用，会导致耐药菌的发生和传播，不仅使抗菌药失效，而且诱发药品不良反应，甚至使人类重回无抗菌药使用的境地。滥用抗菌素不仅起不到好作用，反而有许多坏处。抗菌素都有毒性反应，能对肝、肾、血液、神经系统等造成轻重不等的损伤。不正确应用抗菌素，可使某些细菌产生耐药性，等以后需要用时就不起作用了。还有一种不良后果是产生“二重感染”。所谓“二重感染”，就是在应用抗菌素时由于针对性不强，把一些本来对身体无害的细菌杀死了，而对一些致病性强细菌却不起作用，反而保留下来。因为原来与其对抗的一些细菌被杀死了，所以它更得以滋长，这就给身体造成了新的威胁，甚至因此受感染而得病。四环素牙、部分儿童听力障碍等都是长期服用抗菌药的严重不良反应。曾经有效治愈结核病的链霉素等抗菌药，由于多重耐药菌的产生，现在已经对结核病患者束手无策。因此，国家局规定从2004年7月1日起，对未列入非处方药药品目录的各种抗菌药物，包括抗生素类和磺胺类、喹诺酮类制剂、抗结核药制剂、抗真菌药制剂，在全国范围内所有零售药店必须凭执业医师处方才能销售。
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