文昌鱼是一种动物珍宝。据科学家研究，它早在五亿多年前就出现，至今仍保持着古代的特性及原始性状。这为研究鱼类的起源和无脊椎动物进化历史，提供了活的证据。
在中国，文昌鱼只分布在福建、青岛、台湾等地，而以福建同安县刘五店为最出名，据说“文昌”两字源出于“文昌帝君”。
文昌鱼身长3-5厘米，形态构造十分古怪，躯体细长而侧扁，两头尖尖，活像一条小扁担。全身粉红色，半透明，可看到一条条平行排列的肌肉纵。无鳞、无偶鳍、无脊椎骨。“心脏”只是一根能跳动的腹心管，连眼睛、耳朵、鼻子等感觉器官都没有，消化器官也没有分化。除了口和咽喉区分外，就是一根直肠通肛门。
文昌鱼经常随着潮水游到江河汇合的浅海海底，几乎没有自卫能力，却有惊人的钻土本领，一般可生活三四年。它经常把身体的大部分埋在沙里，仅有前半截身体露在沙外，觅食江水带来的浮游植物。到了繁殖季节，文昌鱼双双成群地钻出沙滩，相互嬉游、交配。雌雄异体，生殖细胞成熟后，排到体外，在水中受精发育。第二天上午受精卵就发育成为能自由游动的幼鱼,3个月以后就长大为成体，而生殖系统要到一年后才发育完全。
生物学家认为，文昌鱼是从无脊椎动物进化到脊椎动物的过渡物种，是鱼类的祖先，但又与鱼类绝然不同，在动物进化过程中有特殊位置，也是一种名贵的水产品。
背景介绍：
文昌鱼是比鱼类低等的动物，其生理构造甚为奇特，它和一般鱼儿不同，没有鱼类常有的鳍，它的鳍只有一层皮膜，虽然也用腮呼吸，但腮却被皮肤和肌肉包裹起来，形成了特殊的围腮腔。它也没有鳞，没有分化的头、眼、耳、鼻等感觉器官，也没有专门的消化系统，只有一个能跳动的、内有无色血液的腹血管和一条承接口腔及肛门的直肠。因此，文昌鱼属无脊椎动物进化至脊椎动物的过渡类型，有人称之为“鱼类的祖先”。
文昌鱼生长于潮汐不大、沙滩较大、风平浪静的内海浅湾。幼鱼生活在泥、沙交界的细沙中。文昌鱼经常随着潮水游到江河汇合的浅海海底，几乎没有自卫能力，却有惊人的钻土本领，一般可生活3－4年。文昌鱼因为无鳍，不能游到远海去觅食，又光溜溜、半透明的难以自卫，只好钻沙，寻觅沉淀在沙里的食物。就是钻沙也钻不深，只在沙的表层。晚上它也会离开沙底，垂直游到水面，寻找海藻等东西吃。文昌鱼没有胸鳍和腹鳍，只有背鳍、尾鳍和臀鳍。白天它躲在海底泥沙中，露出半个身子，摇摇摆摆，依靠水流带来的浮游生物作食饵，晚上出来活动。它垂直游泳，有时会像脱弓的羽箭射到水面上，它会用触须帮助摄取海水中微小的浮游生物。
文昌鱼严格地讲还不能算是鱼，它是一种珍稀小型暖水性底栖动物，还没有鱼类所具有的脊椎，仅有一条脊索，是无脊椎动物向脊椎动物进化的过渡种类，可以说是最原始的鱼。文昌鱼被认为是脊椎动物的祖先，素有“活化石”之称，是研究脊椎动物进化和系统发育的理想材料，在学术上有很高的研究价值。目前地球上这种过渡种类极少，文昌鱼是科学家们研究脊椎动物以及鱼类起源的好材料，所以受到科学家们的青睐。