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siRNA制备方法比较

放大字体  缩小字体 发布日期:2006-07-06

比较项目

化学合成

体外转录

RNase III降解dsRNA

siRNA
表达载体

PCR
表达框

材料需求

21-mer RNA
oligos(
一对)

29-mer DNA oligos(一对)

转录模版 (200-1000bp,两侧带T7 启动子)

55-60-mer DNA oligos(一对)

~50-mer DNA oligos(一对)

全部制备/合成时间所需时间

4—2

24 小时 DNA oligo合成时间

1 转录模版制备时间

5天以上 DNA oligo合成时间

~ 6 小时 DNA oligo合成时间

个人所需操作时间

几乎不需要*

中等

中等

中等

是否需要验证和寻找最有效siRNA

需要

需要

不需要

需要

需要

能否标记siRNA (例如用于荧光显微镜分析siRNA进入细胞过程或者在细胞中的定位)

不能

不能

转染的相对难易程度

可筛选性 (例如抗生素筛选)

不可以

不可以

不可以

可以

不可以

能否用于长效抑制

不可以

不可以

不可以

可以(抗生素筛选)

不可以

能否大规模制备

可以

有限

有限

可以

有限

检测总体转染效率

不可以

不可以

不可以

可以

不可以

每个基因的相对费用(不包含人力)

中等

中等

中等

*取决于合成后是否包含纯化、去保护,以及厂家提供的是已经退火的即用型双链还是冻干的单链

 
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