子囊孢子（ascospore） 指产生在子囊菌子囊内的孢子。在即将形成孢子之前，子囊内进行核融合和减数分裂，一般一个子囊内产生8个孢子，普通为椭圆形，有的是针状态体或带有隔壁。在表面上可以看到纹、刺、网眼等。不同的特征，其颜色也各种各样：有的无色，有的淡黄色、淡红色、橙色、褐色及黑色等。普通在子囊内并列成一排，其一半与另一半性别各 。（例如脉孢菌属、麻孢壳属、Pleurage）。孢子一般在子囊内排成一列，其中半数与其他半数各为不同的性属（例如Neurospora，Gelasinospora，Pleurage）。