子囊菌Sac fungi 产生子囊的菌类的总称。根据爱因渥思（C．Ai-nsworth）和比斯贝（G．R．Bisby）的统计，共有1950属、15000种。除单细胞的酵母菌外，营养体所谓菌丝中有隔膜。通过有性繁殖，在子囊中产生子囊孢子。并且菌丝组成菌丝体，形成含有子囊的子实体。无性繁殖一般是依靠分生孢子。子囊菌有以下几种：不形成子囊果的原子囊菌纲；在假囊壳中形成双层壁子囊的腔菌纲；在各种子囊果中形成单壁子囊的真子囊菌纲。在真子囊菌纲中又有：闭囊果中分散存在着球状子囊，或子囊壳中柱状子囊并列的核菌类；子囊盘内表面柱状子囊并列的盘菌类。也有很多在各方面与子囊菌类似，但不知是否形成子囊一些种类，而把这些归为半知菌纲。