真核生物的基因组相当于基因的一股由只有一个复制DNA序列（也称单一DNA，unique sequence，single copy seqence，nonrepetitive sequence等）和具有多数反复存在的DNA顺序组成。称后者为重复顺序。组成基因组的DNA顺序，根据其重复的频度可分为三类。一是基因组只有一个复制顺序的单一DNA，二为高度重复顺序（highly repetitivesequence），由较短的顺序105—107次直线连结而成，其中含随体DNA等。第三为中等程度的重复顺序（moderately repetitive sequence），为有300—500个核苷对的大致相同的顺序——例如在将哺乳类的DNA用限制酶AluI（AG↓CT）切断时所产主的主要片断中所见到的高频率（105）的顺序（AluIfamily）——与单一DNA一起分散存在的，以及像核糖体RNA基因或组蛋白基因群那样的多次成直线相连存在的（多基因群）都包含在这一类中。此外有在反方向上重复的顺序（inverted repetitive seq－uence），其变性DNA折叠成发夹结构（hairpinstructure，foldback structure，snapback stru－cture），在编码分析中可迅速再结合的类型。