指二个以上系统之间有一部分基因不同而其它基因都相同的纯系鼠,例如C57BL/10(H-2b)系与DBA/2(H-2d)系为不同的系统,但C57BL/10鼠的H-2基因用DBA/2的同基因置换了的B10.D2鼠,有H-2d,但其它基因与C57BL/10是相同的,称B10.D2与C57BL/10为同族。这种仅H-2基因不同的情况称同族抵抗鼠(congenic resistant mou-se)。同族关系并不限与H-2基因有关,例如,C3H系与AKR系二者都为H-2k,但其它基因则不同,例如T细胞特异抗原的Thy 1抗原,在C3H为Thy 1.2,而AKR为Thy 1.1,然而只将AKR的Thy 1.1用C3H的Thy 1.2置换成的AKR-Thy 1.2与原来的AKR系对Thy 1抗原之外的基因来说是同族系。关于形成同族鼠,以Thy 1抗原为例,用C3H与AKR交配,以后以Thy 1.2抗原之有无为指标,与AKR回交(10世代以上),这样在Thy 1抗原以外之基因,便都成了AKR系。同族鼠只是特定的基因产物不同,所以一方的细胞或体液成分可使另一方免疫,可以产生对特定抗原的抗体或免疫反应细胞。这对现代免疫学是很大的贡献。