曾称作细胞器官、小器官、类器官。是指原生质的一部分经过特殊分化而形成的细胞内结构，它们是具有一定功能的有机单位。该词原来是对原生动物细胞内的结构而言，它是根据生物体是由几个器官组成的这一意义而类推出来的。狭义的细胞器有两种情况：（1
）仅限于兼有特殊的酶活性和遗传信息（即DNA
）的结构（核、线粒体、叶绿体）；（2
）包围于细胞膜内，并能明确地与细胞质基质划分开的结构（核、线粒体、叶绿体、溶酶体、微体）。但是，细胞器的意义通常是指所有在结构上、功能上已经分化的原生质结构。一般不包括后生质。