所谓棉花病虫防治的基础工作，说到底就是在棉花播种之前抓好农业防治。农业防治抓好了，就能为棉花高产丰收打下良好的基础。棉花生产的农业防治工作，一是抓好轮作换茬，二是深翻土壤，三是改善水系，四是增肥改土，五是净化环境，这五个方面，均与预防棉花病虫息息相关，现分述如后。

　　不少棉区年复一年地种植棉花，易产生连茬障碍，一是表现土壤缺乏某种元素，二是枯黄萎病菌残存蔓延。采取轮作换茬可较好地缓解这些障碍，一是将棉花与豆科作物换茬，二是将棉花与水稻轮番种植，其间隔时间要达三年以上，在有条件的地方，实行这样的轮作换茬是值得提倡的。

　　两熟棉田在广大棉区正在不断扩大，为了棉花早发早熟，多数两熟棉区都在前茬作物中，为棉花留下了预留棉行。抓住冬春的低温时机，深翻预留棉行，一可疏松耕作层，增强土壤的通透性能；二可冻死部分越冬的害虫；三可清除部分棉田杂草。

　　近几年来棉区很多青壮年劳力外出打工，棉田水系有所失修，旱涝灾害频繁发生，特别是6～7月份，排水不良的棉田，常易诱发枯萎病，严重发病的棉田对棉花产量损失很大。因此，抓好棉田水系设施的完善，疏理棉田三沟，可降低地下水位，预防枯萎病发生，增强棉花抗病能力。

　　近几年，在棉花施肥上，化肥当家的问题越来越突出，对棉花病害的抵御能力逐渐下降。增施有机肥，特别是增施合缘酵素菌生物有机复合肥、高能有机复合肥以及农家积造的各类农家肥，一可以有效地改善棉田土壤，提高保肥供肥能力；二可分泌有机酸抑制枯萎病，预防病害。同时，配施钾肥，可以更有效地预防和大大减轻枯萎病的危害。

　　棉花的病虫一可在棉田土壤中残存，二可靠外界传播。所以，除了以上四项预防措施外，必须要净化棉田及周边的环境。一是不断清理田中杂草；二是捡除棉田土壤内的残留塑料薄膜；三是铲除棉田四周杂草，消除携带病虫的棉株和棉壳。