大豆病毒病是我国大豆生产中危害最大的病害，由多种病毒单一或复合侵染所致，其中大豆花叶病发生最普遍。大豆顶枯病发生率仅次于花叶病，在东北三省、山东省、山西省、江苏省都有发现，另外还有多种病毒可以侵染大豆，在局部地区或一些年份造成危害。
大豆病毒病的症状比较多样，因病毒种类（特别是复合侵染的病毒种类）、大豆品种、侵染时期及环境条件而变。常见的是花叶、皱缩、沿叶脉疱状斑、叶边下卷、顶枯、植株矮小、局部或系统坏死。病种子常表现为从脐部放射状色斑或云纹斑。大豆病毒病称系统性病害，也就是说病毒可以随大豆的输导组织传遍全身。一旦感染大豆花叶病毒，新叶都会出现花叶，这和2,4-滴类除草剂引起的局部药害不一样。
大豆病毒病在流行规律上的显著特点，一是带毒种子长成的病苗为当年发病的侵染源（长江流域病毒也可以在蚕豆、豌豆、紫云英等作物上越冬），而种子带毒后脱毒困难，用药剂处理种子或用生长点培养法也都无效。二是病害依靠蚜虫在田间不断传播。而蚜虫传毒方式为非持久型，即获毒快、传毒快，但失毒也快。经测定，蚜虫在病株上刺吸30秒到1分钟就可带病毒，带毒蚜在健株上吸食1分钟就可以传毒，持续传毒只有75分钟。这就要求使用能够迅速击倒蚜虫的药剂来防治，否则即便能够控制蚜虫数量，但对防病来说并没有显著效果。
许多研究结果证明：播种无毒或低毒种子是控制大豆花叶病的关键措施。为此，要建立无毒种子繁殖体系。种子田要设在距离大豆、蚕豆、花生、紫云英田100米以外的地方；注意选用无毒种子；早期治蚜和拔除病苗；花期认真检查发病情况，选择无病田或发病率不超过0.2%的地块留种或直接从无病区调种。有的农户想通过挑除褐斑粒的办法获得无毒种子，这不可靠，因为有的种子带毒却不表现症状。其次是加强检疫措施，种植抗病品种，调整播种期，清除田边杂草和喷药消灭早期出现的蚜虫。