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苗木茎腐病：多发生在1-2年生实生苗上，苗木受害后，在苗木根颈处皮上出现一圈紫红色，随后转为皮干枯，最后全株死亡。
防治方法：选择排水好的苗圃地，提高播种量，播时施足基肥，4月下旬搭棚遮荫，避免太阳强烈照射。发现病株后立即除掉，用50％的多菌灵800-1000倍液喷雾，间隔7-10天1次，连续2次。
叶枯病：发生在7-8月，受害植株开始在叶片的边缘由部分黄色变成褐色坏死，由局部扩展到整个边缘，出现褐色或红褐色的叶缘病斑。以后病斑逐渐向叶基延伸，使整个叶片变成褐色或灰褐色。
防治方法：2至3月施足基肥，4-7月勤追肥；或在5月底以前施多效锌肥或硼、锰、锌等微量元素混合液，提高植株抗病能力。发病初期，用25％-50％的多；菌灵粉剂500-800倍液喷雾；发病盛期用50％的退菌特800-1000倍喷雾，间隔15-20天一次，连喷2-3次即可。
金龟子：主要是成虫危害；定植1-2年的幼树，在4月下旬至5月中旬幼树展叶期，金龟子晚上出来食叶危害，白天躲在幼树根部。
防治方法：如危害严重可在晚上用1500-2000倍的敌杀死溶液喷雾，如仅个别植株受害，可在晚上进行人工捕杀。
大蚕蛾：以对银杏的主要危害是幼虫取食叶片，4-6月间银杏叶片幼嫩，其幼虫大量取食叶片。
防治方法：在4-5月幼虫刚羽化成群集性时，用50％敌敌畏1500倍液喷雾，或用90％晶体敌白虫1500倍液喷雾。如4-5龄以后，用药量加大，用50％敌敌畏500-600倍液喷雾，效果较好。
超小卷叶蛾：危害时间4月中旬至6月中旬，以幼虫危害严重，刚羽化的幼虫，经1-2天后蛀入嫩梢内危害，会造成被害枝梢枯死，幼果脱落，损失极大。
防治方法：在幼虫刚孵化未蛀入枝梢前或幼虫从枝梢内爬出卷叶时进行喷杀。以敌百虫（90％）：敌敌畏（80％）：水=1：1：800-1000进行喷雾，也可用1500-2000倍敌杀死溶液喷杀。
家白蚁：受害症状是开始出现枝叶枯黄，顶端干枯，植株挂果极少，危害严重的植株，造成树干空心，全树枯死。有家白蚁的树，可在树皮上观察到工蚁和兵蚁外出觅食留下的细小土粒筑成的蚁路。
防治方法：将主干钻通深入蚁巢施药，钻孔部位在羽化孔下方离地面15CM处，35度倾斜钻入权专。深度大于主干半径。清除钻孔内木屑，用胶囊喷粉器向孔内喷白蚁药（常规配方+10％灭蚁灵），每洞喷20-25G，喷后用废纸或泥土堵塞孔口。
