扑草净为选择性内吸传导型除草剂，可从根部吸收，也可从茎叶渗入体内，运输至绿色叶片内抑制光合作用，中毒杂草失绿逐渐干枯死亡。其选择性与植物生态和生化反应的差异有关，对刚萌发的杂草防效最好。扑草净水溶性较低，施药后可被土壤吸附在0～5厘米表土中，形成药层，杂草萌发出土时接触药剂而受害，持效期20～70天，旱地较水田长，黏土中更长。该药在有机质含量低的沙质土上不宜使用；称量应准确，撒施要均匀，可先将称好的药剂与少量细土混匀，均匀撒施，否则易产生药害；适当的土壤水分是发挥药效的重要因素。