留种：一是选无病地块留种，防止薯块带病入窖，从采苗圃剪蔓的夏薯留种很少带病，不能用春薯和炕苗、温床苗栽的夏薯留种，受水淹的地块也不宜留种。二是适时收刨，防止窖外冻害。如果在田间受冻害，在贮藏前（入窖20天左右）就会腐烂。收刨种薯最好在10月中旬开始，霜降前收完。选晴暖天气上午收刨，当天下午入窖，这样经过中午晾晒，能减轻破皮。如不能当天入窖，必须注意覆盖防冻。若留种田遭受霜冻，要剔除露出地面受冻的薯块。三是实行“四轻”，防止破皮。伤口是病菌侵染的门户，为防破伤，收刨时要做到轻刨、轻装、轻运、轻放，严格剔除破伤薯块，直接入窖堆放。四是留足单放，防止侵染。留种数量，一般每栽一亩春薯要留种60公斤。单窖单放或单堆单放，不可与食用甘薯混放，不同品种也要分别存放。

种薯安全贮藏：一是因地制宜选择贮藏窖。常用的有井窖、棚窖、崖头窖和永久大窖，只要将窖管理好，都能安全贮藏。二是做好入窖工作。入窖前，旧窖要清扫消毒，井窖、崖头窖要刮去一层田土，也可用硫磺点燃后盖严窖口、气眼熏蒸消毒（1立方米用硫磺100克），入窖时轻拿轻放堆放整齐，贮量一般占薯窖空间2/3为宜。三是保证贮藏的适宜温度。一般入窖初期温度可能高些，应开窖口和气眼，散热排湿，待窖温基本稳定在14℃—15℃时适时关闭窖口、气眼，防窖温急剧下降。在贮藏中期，为保证窖温不低于10℃，除关窖门及气眼外，还可加厚窖顶盖土或垛草，薯堆上也可盖草，薯堆外垛草墙、窖旁设置挡风障等。贮藏后期天气转暖，也要注意寒流。四是防止贮藏期湿窖。窖内湿度过大，若保暖不好，常会产生凝结的气流水附在薯块表面，引起烂窖。防止方法是在薯堆上盖一层草或草苫吸水汽，草湿了可再换干的。五是适当通风，防止闷窖腐烂。这种现象多发生在深井窖，在封窖早、装得满、窖温高、薯块破伤多的情况下发生。要注意在晴暖天气适当打开窖口通风，防止闷窖腐烂。