根部病虫害主要有孢囊线虫病、根腐病、根潜蝇、黑绒金龟甲、地老虎。
防治方法：
　　1.农艺措施：①搞好大豆品种更换，避免长期种植单一品种，提高大豆自身的抗病，耐虫能力。②提倡机械化选种，以清除病粒、虫食粒、杂草籽、杂质，减少病虫侵害机会。③适期播种，依据各地病虫害发生情况；采取早播或延后播种的方法达到躲病避虫的目的。④及早耕翻，精细整地，尽量清除病残体，减少害虫越冬机率。
2.化学防治：①对孢囊线虫和根蛆重的地块采取5%甲拌磷(Ⅱ)，配合“三垄栽培”播种方式随种肥下地；还可采用种衣剂，按药：种为1：75比例包衣。35%甲基硫环磷、35%乙基硫环磷，按种子量0.5%拌种，其中应用5%甲拌磷还可兼治二条叶甲、蓟马、红蜘蛛等苗期害虫。大豆黑绒金龟甲、地老虎亦可应用上述方法。⑧在根腐病重的地块，采和50%多福合剂，按种子量0.5%拌种。②在根部病虫害混发区，可采取杀虫剂、杀菌剂混合拌种。
大豆重迎茬生育期间的病虫害主要有大豆霜霉病、大豆灰斑病、大豆食心虫。
防治措施：
　　1.农业防治：在大豆生育期内搞好中耕，促进新生根的大量形成，破坏病原菌生存环境。加强大豆生育期问病虫害预测预报工作，准确及时地确定防治期，进行有效防治；
2.药剂防治：①在大豆霜霉病重的地块，采用50%福美双按种子量的0.5%拌种。发病初期可喷75%百菌清可湿性粉剂或25%瑞毒霉可湿性粉剂，每亩l00-125克兑水喷雾，每7-lO天喷1次，一般需2次；②大豆灰斑病发生地块采取50%多菌灵可湿性粉剂喷雾；③大豆食心虫防治，在封垄好的地块采用敌敌畏熏蒸法或5%甲拌磷撤施法。具体方法：用玉米秆制成毒棍，每6垄插l行，每6米远插l枝，每亩插30枝，药效可保持7天左右。撤施甲拌磷每隔6垄撤施1垄。在封垄差的地块，可采用菊酯类农药喷雾方法防治；④在病虫害混发区可采用杀虫剂、杀菌剂配合使用。