辣椒白粉病病菌在营养生长阶段菌丝都藏在叶片里面，等到产生繁殖体的时候，才伸出叶面。一旦发现病斑，再用药防治就困难了。因此，防治该病一定要早，最好在将要发病的时候，就隔几天使用一次保护性杀菌剂。田间出现病叶后，必须使用内吸性药，而且还要使用多次。用药后下面的黄叶并不见少，只是将新生的叶片保住了。

可使用的保护剂有：50%硫悬浮剂500倍液、75%百菌清可湿性粉剂500倍液、70%代森锰锌可湿性粉剂400倍液、80%大生可湿性粉剂500倍液。内吸性杀菌剂有：50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液、15%粉锈宁（三唑酮）乳油1000倍液、40%福星乳油8000-10000倍液、10%世高水分散性颗粒剂2000-3000倍液、25%腈菌唑乳油500-600倍液。复配剂有：40%多硫悬浮剂400-500倍液。将10%世高水分散性颗粒剂（3000倍液）与75%百菌清可湿性粉剂（500倍液）混用，效果较好。

使用内吸性杀菌剂的时候要注意病菌的抗药性，使用多菌灵及甲基托布津效果不好的，可换用粉锈宁或福星；使用粉锈宁及福星效果不好的，可用世高或腈菌唑。