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第一，首先是高温闷床。由于育苗时间提早到9月1日至10日，比原来早了一个多月，此时气温尚高，部分棚户还像原来一样，高温管理，盖地膜，常造成“闷床”。
第二，苗床过湿或过干。有的苗床育苗时，水量小，南瓜籽吸水不足，表墒差，造成出苗困难或出苗后南瓜子叶扭曲不展。还有苗床湿度过大，又赶上高温，导致苗床发生霉菌感染，引起烂床。
第三，苗床土选用不当或种子消毒差。有些棚户在棚内就地取土育苗，种子又不消毒，由于棚内土中施入大量的肥料，小苗本身耐性差，常引起烧根或杂菌感染等，导致育苗失败。
针对以上这些原因，在南瓜育苗上，必须改进育苗方法。
第一，选择适宜的育苗场所。若9月1日至10日育苗，可在温室外搭小拱棚育苗，育苗时，小拱棚上搭设塑料布四周卷起30公分，围上防虫纱，中午如有特殊的高温天气可适当遮阴。
第二，采用半砂床育苗。即在苗床上铺5公分厚的建筑纱，浇透水后，在砂床上撒800倍凯克星药土，上播南瓜籽，南瓜籽播时不要过密，保持1.2-1.5公分间距，上盖3公分厚的细土，这样床土透气性好，南瓜根系发育好，起苗时又不伤根。
第三，严格控制苗床内温湿度。小拱棚内要挂上温度计。出苗期间苗床温度严格控制在28-30℃之间，不超过33℃，早期育苗，苗床上不要加盖地膜，为保墒，床面上可盖些报纸或湿被单等。
第四，为保证苗齐苗壮，南瓜籽应预先晒种、浸种和药剂拌种。
⑴晒种：播前1-2天选晴天，在苇席上晾晒2小时，以提高芽势。⑵药剂浸种：种子浸种时先用1000倍凯克星或根复生药液浸半小时，然后再用凉水浸4小时，捞出后晾去明水播种。⑶药剂拌种：播前先用凉水浸4小时，捞出后用“适乐时”拌种，再播种，可起到苗齐苗壮的作用。
第五，南瓜出苗后喷药防猝倒病及霉菌感染。
见南瓜苗拱土，及时撤去报纸，被单等覆盖物，苗床普遍喷一遍药液如：恶霜灵1袋+小爱多收1袋或多宝苗菌灭1袋+生命1号1/2支，可避免烂床。
