白菜根肿病为真菌性病害，土壤能带菌传播，难以用药防治，重病田应实行轮作。根肿病在酸性土壤上更容易发生，适当对土壤用石灰调整酸碱度，有利于减轻病害。

轻病田可以在播种前结合耕整地对病田土壤用硫酸铜消毒。发病初期用铜高尚27.12%碱式硫酸铜悬浮剂（澳大利亚纽发姆有限公司产品，购货联系电话：13851940748）、普力克722克/升霜霉威水剂（德国拜耳作物科学公司产品）等药灌根。其中，碱式硫酸铜为保护性广谱杀菌剂，对根肿病等真菌性病害和软腐病等细菌性病害都有良好的预防作用，最好在病菌侵入作物前使用；霜霉威对根肿病、霜霉病等真菌性病害有较好的预防和治疗作用，适宜在病害刚开始发生时使用。对重病田，最好趁高温期，在蔬菜采收后灌水湿土，覆盖塑料薄膜并密闭四周，使膜下土壤温度达60℃左右后维持1周左右时间，这样大概花10天左右时间，就能大量杀灭土壤中的病原微生物，大幅度减轻下茬菜病害的发生。