冬季正是害虫、病菌的休眠期。此时病虫比较集中，是防治病虫的最好时机，可起到事半功倍的效果。具体方法如下：
1．清洁果园有些害虫的卵、幼虫、蛹及病菌的孢子和菌丝体，能在枯枝落叶中安全越冬，如螨类、介壳虫类、卷叶蛾类、炭疽病、黑星病、溃疡病等。因此冬季应彻底清园，清除枯枝落叶，拾净落果，铲除杂草，集中烧毁或深埋，是减少虫源、病源的较好措施。
2．剪除病虫枝冬季有许多害虫、病菌在嫩枝、芽、叶、干枯枝上越冬，剪除病虫枝、病僵果，集中烧毁，可有效地降低蚜虫、刺蛾、蓑蛾、木虱、茎蜂等害虫的越冬基数，可以减少多种枝叶病虫害的浸染源。
3．堵虫孔对于蛀干害虫中的天牛类可用细铁丝插进枝干上的虫孔，刺死幼虫；也可用80％敌敌畏或40％乐果5～10倍液，用脱脂棉（或废纸）灌药堵虫孔；或用针管向虫孔注射上述药液，然后用黄泥封洞口，可将躲在枝干内的害虫毒死。
4．刮治果树的树皮裂缝、翘皮是许多病虫潜伏越冬的处所。如梨和苹果小食心虫、网蝽、毛虫、小卷叶蛾等，冬季有躲进翘皮群巢越冬的习性。因此，可在12月中、下旬至翌年１月的时间内，把老裂后的翘皮轻轻刮去，但勿刮伤里面的嫩皮。梨膏药病菌膜亦可用刀刮除，刮后应立即涂上石硫合剂或涂臼。
5．果园深翻有许多害虫，以幼虫、蛹的形态或以菌体、卵孢子在土壤中越冬。冬季进行果园深翻，可闷死或暴露虫、蛹、病菌，让鸟啄食或冻死。