柚树进入盛果期后，在营养生长与生殖生长的动态平衡中，生殖生长占优势，表现为花量多，挂果能力强，枝叶生长量逐渐减少。若不注意加以调节，常由于结果量过多，造成枝梢与根系生长不良，影响坐果能力，易使盛果期缩短，树势早衰，也会造成大小年结果。据潘松琴等对玉环文旦柚的调查，车产稳产树的冠高率(树冠最大横径／树高)为90%～100%，新梢长8～10厘米，枝多，叶幕层厚，树冠通风透光良好，这可作为盛产期柚树修剪的参考。修剪可分冬季修剪与夏季修剪两个时期进行。 冬季修剪是在采果后至春芽萌动前半个月进行，通常在 12月中下旬至1月中旬进行。
回缩：即对在树冠中上部较粗大的部分衰弱枝，于枝径粗1．5～2厘米处，留15～20厘米，剪去顶部，加强树冠内膛的通风透光，促发健壮春梢，恢复树势，增加结果。
修剪：剪除病虫枝、枯枝，疏剪树冠外围中上部过密的交叉枝及纤弱枝等。夏季修剪一般在7月下旬至8月上旬放秋梢前15～20天进行。其目的促抽健壮秋梢，恢复树势。主要是疏删部分落花落果枝、纤弱枝及病虫枝，对抹除夏梢后枝梢顶部已形成的瘤状膨大部分要行短截。对弱树与结果多的植株可适当重剪，以促发秋梢。对突出在树冠外围的强枝与徒长性枝梢，要去除或短截。
修剪时应按不同的枝梢分别处理。
下垂枝。幼龄树可适当保留下垂枝，让它提早结果。但至成年树，由于下垂枝生长势弱，结果不良，可在弯曲下垂部分短截，使其向上生长。
内膛枝。柚树冠内膛枝梢能够结果，不能随便疏删，只有过于郁蔽时才进行部分疏删。
交叉枝、重叠枝。当出现交叉枝、重叠枝时，容易造成树冠郁蔽和枝梢生长不良，应加以修剪。修剪的原则是：留空去密，留强去弱，并剪去向内生长的枝梢。
徒长枝。徒长枝易扰乱树形，且易破坏树冠的平衡，应及时剪去。尤其是发生于树冠夕防并突出于树冠者应从基部疏删。但若发生于树冠空隙处，可考虑保留，并加以适当短截，促长分枝，补充树冠空隙。对于衰弱枝序亦可利用徒长枝短截后作更新枝用。
修剪的步骤：
先观察全树生长情况，决定修剪程度，再按照树冠各种枝梢的分布与着生情况，决定修剪方法。
先去除无用的大枝。剪除大枝时，先摇动大枝，看它枝叶分布的范围，再行修剪，以免修剪过重，导致树冠过空。
修剪小枝时，应以大的主枝为单位，顺序进行，一般先剪枯枝、病虫枝、纤弱枝，疏去交叉枝、密生枝，以及过于荫蔽的内膛枝和失去结果能力的下部枝梢。修剪时剪口要平滑，不留残桩。
由于不同柚品种的生长结果习性不同，修剪的要点也相应不同，如沙田柚的修剪要点是顶上重，下部轻，外围重、内部轻。保留树冠内膛中2年生以上的枝梢(含2年生无叶枝)，疏删顶部及外围密生枝。玉环文旦柚修剪的要点是控上促下，控外促内，去长留短，疏强留弱，保留15厘米左右短壮充实的春梢作结果母枝，抹除夏秋梢，短截徒长枝和荫蔽枝。