秋季仍是水产养殖病害防治的关键季节，养殖户千万不可麻痹大意。水产动物发病季节虽以高温季节为主，但是秋季水温仍较高，病原生物活动仍很猖獗。另外秋季池塘承载量已经很大，加上昼夜温差大，早晨多雾，夜间上下水层的对流易引起全塘缺氧，造成泛塘。秋季池塘承载量大，残留饲料、排泄物、腐烂的水草、死亡的生物体遗骸等沉入水底，使淤泥增厚。这些有机物分解消耗大量氧气，产生大量有害气体，引起养殖动物慢性中毒；水体下层长期缺氧，病菌大量繁殖；水体酸度增加，养殖动物的血液栽氧能力下降。这些都是引起秋季水产动物病害暴发的因素。

因此，秋季要保证水产动物安全，在养殖管理上需要做好以下几点：⑴改良水质、底质。提高水位，降低养殖动物的相对密度，每10-20天加水1次，每次加水10-20厘米。适时使用增氧机，达到增氧、搅水的目的，促进底泥释放出氮磷钾等营养元素。使用光合细菌、EM菌、芽孢杆菌等微生物制剂，改善水体生态环境，抑制致病菌繁殖。用生石灰化浆全池泼洒，调节水体PH值，也可使用底质改良剂，使水中的悬浮有机质沉淀，并使底质疏松通气。⑵科学投喂。秋季是水产养殖动物生长最适时期，要适当增加投饲量，延长吃食时间。选用营养平衡、品质稳定的配合饲料，不喂单一、过期、霉变的饲料。投喂配合饲料的同时适当增投青饲料。越冬鱼种池要尽量晚停食。⑶正确诊断，对症下药。有许多不同的疾病有着相似的症状，需要进行正确诊断。另外注意正确的用药时间、方法和用量，注意药物之间的合理配伍，提倡使用中草药代替部分抗生素来防治疾病。