每个实验室都应设置严密的废弃物清单，固体的、液体的与气体的，包括未能用尽的试剂及其包装、实验过程的副产品与泄漏物、实验结束后的清理物，根据化学药品和样品废弃物的理化特性，进行分类例如毒性、放射性、腐蚀性、酸碱性、易燃性、爆炸性、氧化性、还原性、污染性。
对每一类废弃物应标明来源、主要组成、化合物性质，提示可能产生的有毒气体、发热、喷溅及爆炸等危险。为防止二次污染，以尽量选用无害或易于处理的药品或方法为原则，标明具体处理措施，如用漂白粉处理含氰废水，用生石灰处理某些酸液，用废酸液“以废治废”处理废碱液。无法妥善处理，必须标明合法的专业处理机构名称。
进行室内暂存时，应根据性质分类放入室内实验室废弃物暂存柜中存放，柜体表面应贴有醒目的警示标示，提醒周围人群注意废液分类安全。
处理实验室废弃物时，应建立严格的处置台账，对处理人、处理数量、处理方式、处理时间等相关信息进行详细记录，双人审核，定期检查，长期存档。

实验室废弃物应依不同性质进行分类收集，不具相容性的实验废弃物应分别收集储存，应由检测人员按分类规定进行分类收集，分别倒于实验室指定的储存容器内收集。对易燃、易爆、剧毒等化学物品在使用中及使用后的废渣、废液，实验操作人员应及时妥善处理、分类倒入指定的容器内，严禁乱放乱丢。对实验使用后的培养基、标本和菌种保存液，一次性的医疗用品及一次性的器械，都应严格按规定进行有效消毒并放置指定的容器内。

废弃物的正确包装关键是选对容器，贴准标签。废弃物应装在设计及构造适当的密闭容器内，分别是不锈钢桶、塑料桶和玻璃瓶。容器及封盖上任何直接与废弃物接触的部分，不能与废弃物发生反应而产生危险产品或减弱容器的坚固性。必要时，容器及封盖应加内衬垫、涂层或予以其他处理，容器或衬垫的材质应充分考虑其化学稳定性。
所有废弃物的装载容器都应密封完好，表面清洁，标识清晰易读，标签贴附牢固，旧标签全部去除。标签的样式和尺寸应参照规范。标签材质以防腐、耐磨为佳。规范的标签在为实验室提供安全警示的同时，也科学的装饰了实验室。
容器标签上应标明废弃物名称、类别、危险情况、安全措施、实验室废弃物产生单位、地址、电话及日期等信息。当含有多种化学品时，一般只须列出主要废弃物成分。

为确保废弃物能够抵御自然外力及人为因素的破坏，应高度重视贮存场所建设，贮存设施、设计、运行、安全防护和监测等均应符合标准，并在明显处设置警示牌，应有专人负责，定期检查并记录，定期联系相关专业单位，对废弃物进行专业化处理。废弃物的贮：
1.远离热源，对高温易爆或易腐败的特殊废弃物还应在低温下贮存。
2.要分类贮存，不相容的废弃物不得混合贮存，且废弃物容器上应加贴标签，对混合后有可能产生危险后果的不同类别，对不同来源的废弃物，切勿贪省事而装载在同一容器内。
3.要防止膨胀，确保容器内的液体废弃物在正常的处理、存放及运输时，不因温度或其他物理状况转变而膨胀，造成容器泄漏或永久变形。
4.要通风良好，不得有散遗、渗出、污染地面或散发恶臭等情形。制订严格的操作规范，要求实验室人员必须按规范处理废弃物，如配备专用的防溅眼罩、手套和工作服，在特殊情况下于通风柜外处理废弃物时，操作人员必须带上具有过滤功能的防毒面具。制订严格的应急程序，在醒目处张贴，定期组织应急演练，备置足够、合格的应急器材，以应对在处理、收集及存放实验室废弃物时发生的溢出、泄露、火灾等紧急情况。