矿泉水含有多种对人体有益的物质和游离的二氧化碳，但如果饮用过多矿泉水，会影响胃液的分泌和胃的消化机能，还会影响胆汁的形成和分泌，从而导致人体内的酸碱失调。
由于矿泉水中含有较多的矿物质，过量饮用会使这些矿物质盐刺激肾脏和膀胱，增加肾脏和膀胱的负担。所以患有慢性肾炎、高血压、心脏病及伴有浮肿的病人不宜饮用矿泉水，更不能将矿泉水当作治病的药水服用。
适量的钙摄入可以促进人的骨架、牙齿发育，增加细胞的通透性等，但是如果过量补充则会引起高钙血症，使人出现软弱无力、食欲不振、呕吐腹泻等痛苦症状，而且过量的钙可能导致肾结石，所以结石患者要少喝矿泉水；
锌元素补充过多，不但会影响到身体其他微量元素的正常吸收和利用，而且还可能引起身体组织的损伤；
铁元素摄入过量可能会引发肝硬化和糖尿病，急性铁中毒者还会迅速休克，严重者甚至会有生命危险；
碘元素补充过量，则会出现脱发、指甲变脆、易疲劳、胃肠功能紊乱、浮肿、不育等症状。
此外，一些矿泉水中还含有极微量的铅、汞、镉等有毒有害元素，因此，作为生产企业，在积极开发多种矿泉水的同时，应当严格把关，最大限度地分离或除去有害微量元素。
