RNA编辑广泛存在于植物的线粒体和叶绿体中。RNA编辑作为一种RNA转录后加工机制,对于调控基因表达具有重要意义。RNA C-U的编辑是胞嘧啶(C)经过脱氨转变为尿嘧啶(U)的过程。在此过程中,PPR (pentatricopeptide repeat)结构域通常负责识别编辑位点,而DYW结构域则负责提供脱氨酶活性完成C-U的编辑。然而,E类和E+类PPR蛋白因缺失DYW结构域无法单独完成脱氨过程,需要分别通过招募脱氨酶PCW1(PPR motif, coiled-coil, and DYW domain-co
ntaining protein 1)和DYW2进行RNA编辑。目前,尽管?a href='//www.sqrdapp.com/news/tag_2319.html' class='zdbq' title='玉米相关食品资讯' target='_blank'>玉米中已有多个PPR蛋白被报道参与RNA的编辑过程,但仍有许多RNA编辑因子有待于进一步挖掘、/div>
近日,中国科学院遗传与发肱a href='//www.sqrdapp.com/news/tag_4780.html' class='zdbq' title='生物相关食品资讯' target='_blank'>生物学研究所陈化榜研究组撰写的题为DEFECTIVE KERNEL 56 functions in mitocho
ndrial RNA editing and maize seed development的研究论文,在线发表在《植生生理》(Plant Physiology,DOI?0.1093/plphys/kiad598)上、/div>
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本研究鉴定了一个影响玉米籽粒发育的DEK56基因。DEK56编码一个线粒体定位的E类PPR蛋白。该蛋白突变后造成玉米籽粒胚胎发生和胚乳发育停滞,籽粒种皮颜色发白、皱缩。研究通过STS-PCRseq(strand- and trans
cript-specific RNA sequencing)分析发现,突变体dek56?1个线粒体基因?8个编辑位点C-U的编辑效率发生了明显改变。其中,matR(maturase-related?1124位点C-U的编辑几乎完全丧失。进一步,研究发现,DEK56能够在ZmMORFs(Multiple Organellar RNA Editing Factors)和ZmGRP23 (GLUTAMINE-RICHPROTEIN23)的辅助下招募PCW1来完成RNA C-U的编辑。此外,RT-PCR和RT-qPCR结果表明,线粒体氧化磷酸化基因nad4(NADH dehydrogenase subunit 4)的内含??的剪接效率在dek56中显著降低。这种剪接缺陷直接导致nad4的转录和翻译水平下降,造成线粒体复合物I组装异常、活性降低,从而引起能量供应不足,最终导致玉米籽粒败育。基于上述成果,该研究揭示了PPR蛋白DEK56在线粒体RNA编辑和玉米籽粒发育方面的重要作用、/div>
研究工作得到国家重点研发计划的支持、/div>
日期9a href="//www.sqrdapp.com/news/2023-11-16.html">2023-11-16
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