中国农业科学院作科所牵头完æˆé«˜è´¨é‡è±Œè±†å‚考基因组和泛基因组解æžü/h1>
核心æ示ï¼?æœ?2日,中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异ç§è´¨èµ„æºå‘掘与创新利用创新团队è”åˆå›½å†…外多家åˆä½œå•ä½ï¼ŒæˆåŠŸç»˜åˆ¶äº†ä¸­å›½è±Œè±†åŸºå› ç»„高质é‡ç²¾ç»†ç‰©ç†å›¾è°±ï¼Œæž„建了栽培和野生豌豆泛基因组,解æžäº†è±Œè±†åŸºå› ç»„进化特å¾ã€ç¾¤ä½“é—传结构,为æ­ç¤ºè±Œè±†èµ·æºé©¯åŒ–,以åŠåŸºå› æŒ–掘ã€ç§è´¨åˆ›æ–°ã€è‚²ç§æ”¹è‰¯æ供了å®è´µèµ„æºåŠæ•°æ®æ”¯æ’‘ã€ü/div>
  9æœ?2日,中国农业科学院作物科学研究所特色 农作ç‰?/a>优异ç§è´¨èµ„æºå‘掘与创新利用创新团队è”åˆå›½å†…外多家åˆä½œå•ä½ï¼ŒæˆåŠŸç»˜åˆ¶äº†ä¸­å›½ 豌豆 基因组高质é‡ç²¾ç»†ç‰©ç†å›¾è°±ï¼Œæž„建了栽培和野生豌豆泛基因组,解æžäº†è±Œè±†åŸºå› ç»„进化特å¾ã€ç¾¤ä½“é—传结构,为æ­ç¤ºè±Œè±†èµ·æºé©¯åŒ–,以åŠåŸºå› æŒ–掘ã€ç§è´¨åˆ›æ–°ã€è‚²ç§æ”¹è‰¯æ供了å®è´µèµ„æºåŠæ•°æ®æ”¯æ’‘。相关研究æˆæžœä»¥é•¿æ–‡çš„å½¢å¼åœ¨çº¿å‘表在《自然é—传学(Nature Genetics)》æ‚志上ã€ü/div>
  豌豆是粮èœé¥²ç»¿è‚¥å…¼ç”¨çš„北方一年生和å—方越年生冷季食用豆类作物,具有丰富的è¥å…»ä»·å€¼å’Œæ˜¾è‘—的生æ€ä¼˜åŠ¿ï¼Œåœ¨ä¸–界范围内广泛ç§æ¤ã€‚自孟德尔å‘现é—传定律以æ¥ï¼Œè±Œè±†ä½œä¸ºé—传研究的模å¼æ¤ç‰©ï¼Œå—到了学界和公众的广泛关注。然而,豌豆基因组éžå¸¸å¤§ï¼Œç»„装起æ¥ç›¸å½“å¤æ‚,豌豆高质é‡åŸºå› ç»„精细物ç†å›¾è°±ä¸€ç›´æœªèƒ½å®Œæˆï¼Œä¸¥é‡é˜»ç¢äº†è±Œè±†çš„ç†è®ºå’Œåº”用研究ã€ü/div>
  该研究团队利用中国豌豆主栽å“ç§?ldquo;中豌6å?rdquo;,基于多ç§å…ˆè¿›æµ‹åºæŠ€æœ¯ï¼Œæ•´åˆä¼˜åŒ–多ç§ç»„装策略,æ供了显著改进的豌豆高质é‡ç²¾ç»†ç‰©ç†å›¾è°±å’Œæ³¨é‡Šã€‚中è±?å·åŸºå› ç»„组装大å°çº¦ä¸º3.8 Gb,综åˆå¤šç§åŸºå› ç»„组装评估方法,一致è¯æ˜Žè¯¥åŸºå› ç»„在å¤æ‚é‡å¤åŒºåŸŸå’Œè½¬åº§å­è¿žç»­æ€§ã€å‡†ç¡®æ€§å’Œå®Œæ•´æ€§æ–¹é¢éƒ½æœ‰ä¼˜å¼‚表现ã€ü/div>
  研究人员还æ­ç¤ºäº†118 个栽培和野生豌豆ç§è´¨çš„基因组å˜å¼‚å¼æ ·ï¼Œè§£å†³äº†é•¿æœŸä»¥æ¥å…³äºŽè±Œè±†å±žç‰©ç§åˆ’分的争议,è¯æ˜Žäº†åŸƒå¡žä¿„比亚豌豆是与野生豌豆和栽培豌豆ä¸åŒçš„独立物ç§ï¼Œä¸ºè±Œè±†èµ·æºé©¯åŒ–æ供了新的è§è§£ã€‚研究分æžé‰´å®šå‡ºäº?5 个与12个豌豆é‡è¦å†œè‰ºæ€§çŠ¶ç›¸å…³çš„æ•°é‡æ€§çŠ¶ä½ç‚¹ï¼ˆQTLs),还å‘现了两个先å‰å·²çŸ¥çš„控制粒型(圆粒/皱粒)和株高(高/矮)的孟德尔基因Rå’ŒLe,以åŠä¸€ä¸ªä¸Žèšåž‹ï¼ˆç¡¬è?软èšï¼‰ç›¸å…³çš„候选基因ã€ü/div>
  åŒæ—¶ï¼Œç ”究构建了包å«116 个栽培和野生豌豆ç§è´¨çš„泛基因组,èšç±»ç”Ÿæˆäº?12,776个泛基因簇,在豌豆属下ä¸åŒç‰©ç§ä¹‹é—´æ˜¾ç¤ºå‡ºå·®å¼‚显著的存åœ?缺失å˜å¼‚(PAV)模å¼å’ŒåŠŸèƒ½å¯Œé›†ï¼Œå…¶ä¸­ï¼Œé‡Žç”Ÿè±Œè±†å’ŒåŸƒå¡žä¿„比亚豌豆中特有的泛基因显示出明显ä¸åŒçš„功能富集,表明它们在未æ¥ä½œä¸ºè±Œè±†è‚²ç§èµ„æºçš„é‡è¦æ½œåŠ›ã€ü/div>
  该æˆæžœçš„å‘表æ°é€¢å­Ÿå¾·å°”诞辰200周年,豌豆高质é‡å‚考基因组和泛基因组的å‘布,拓宽了我们对豌豆巨大基因组背åŽé—传学的了解,为豌豆ç§è´¨èµ„æºå’Œè‚²ç§æ”¹è‰¯ç ”究æ供了å®è´µçš„基因组资æºã€ü/div>
  作科所æ¨æ¶›å‰¯ç ”究员和刘è£åŠ©ç†ç ”究员ã€ä¸­ç§‘院微生物所骆迎峰副研究员和胡æ¾å¹´ç ”究员以åŠå±±ä¸œçœå†œç§‘院农作物ç§è´¨èµ„æºç ”究所王栋助ç†ç ”究员为论文的共åŒç¬¬ä¸€ä½œè€…。作科所宗绪晓研究员ã€ä¸­ç§‘院微生物所高胜寒特别研究助ç†ã€å±±ä¸œçœå†œç§‘院农作物ç§è´¨èµ„æºç ”究所ä¸æ±‰å‡¤ç ”究员ã€å›½é™…åŠå¹²æ—±çƒ­å¸¦ä½œç‰©ç ”究所和澳大利亚默多克大学Rajeev K Varshney教授为论文的共åŒé€šè®¯ä½œè€…。该研究得到了国家é‡ç‚¹ç ”å‘计划ã€å›½å®¶è‡ªç„¶ç§‘学基金ã€é£Ÿç”¨è±†çŽ°ä»£äº§ä¸šæŠ€æœ¯ä½“ç³»ã€ä½œç‰©ç§è´¨èµ„æºä¿æŠ¤å’Œä¸­å›½å†œä¸šç§‘学院创新工程等项目的支æŒã€ü/div>
  文章链接:https://doi.org/10.1038/s41588-022-01172-2
日期9üa href="//www.sqrdapp.com/news/2022-09-26.html">2022-09-26
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