中国水产科学研究院淡水中心在淡水螺类遗传与苗种繁育研究方面取得新进展

　　近日，中国水产科学研究院创新团队、淡水渔业研究中心“长江特色水生动物繁养创新团队”在淡水螺类遗传与苗种繁育研究方面取得新进展。

 

　　梨形环棱螺（B. purificata）俗称螺蛳、石螺、豆田螺、湖螺，是环棱螺属中个体最大的种，具有分布广、用途多的优点，既是中华绒螯蟹、中华鳖、青鱼等优质水产品的重要天然饵料，也是特色水产品宽体金线蛭的唯一饵料来源，更是广大市民“菜篮子”工程的重要组成部分之一。作为柳州螺蛳粉重要原料之一，梨形环棱螺的短缺一定程度上也限制了地方特色产业的快速发展。此外，在淡水水域生态系统中，梨形环棱螺对维持淡水水生态系统平衡同样具有不可替代的作用。

 

　　自2015年起，团队围绕梨形环棱螺群体遗传学、选择育种、池塘一级净化区不投饵养殖和“稻螺共作”等生产方式及水产品加工领域开展了系列研究，为梨形环棱螺规模化繁养积累了一系列解决方案。

 

　　为了进一步挖掘梨形环棱螺种质资源，团队通过PacBio测序和Hi-C技术组装获得了首个梨形环棱螺染色体水平基因组，共产生了33.64Gb的环形一致性序列。初步组装的梨形环棱螺基因组大小为1.01Gb，Contig N50长45.14Mb。通过Hi-C技术的纠错，最终得到984.33Mb大小的梨形环棱螺基因组，Contig N50长37.21Mb，scaffold N50长141.97 Mb，并将99.28%的基因组序列锚定到8条染色体上，共预测了22125个蛋白编码基因。系统进化分析表明：梨形环棱螺与福寿螺大约在2.88亿年前产生分化；比较基因组分析表明：梨形环棱螺中有34个基因家族发生扩张，26个基因家族发生收缩，4个蛋白编码的基因被正选择（FDR<0.05）。该研究为进一步探究淡水螺类的生态学、进化及选择育种提供了重要的基因组资源。

 

　　相关研究论文“Chromosome-level genome assembly of the freshwater snail Bellamya purificata （Caenogastropoda）”在线发表于JCR一区期刊《Zoological Research》（IF=6.975）上。淡水中心水产养殖研究室金武博士、华中农业大学水产学院曹小娟副教授为共同第一作者，徐东坡研究员和闻海波研究员为共同通讯作者。全文网址：https://www.zoores.ac.cn/en/article/doi/10.24272/j.issn.2095-8137.2022.118

 

　　本研究得到了水科院基本科研业务费（2021XT703）和淡水中心基本业务费（2021JBFM07）资助。

 

　　（院长江特色水生动物繁养创新团队、水产养殖研究室、水生生物资源研究室 供稿）