中国科学院昆明动物所等构建文昌鱼胚胎å•ç»†èƒžæ°´å¹³çš„细胞分化谱系

放大字体缩å°å­—体时间ï¼?022-07-06 09:22 æ¥æºï¼šä¸­å›½ç§‘学院
核心æ示:该研究è”åˆSplit-seqå•ç»†èƒžè½¬å½•ç»„测åºï¼ˆsnRNA-seq)和10× Genomicså•ç»†èƒžè¡¨è§‚组测åºï¼ˆscATAC-seq)技术,以å•ç»†èƒžåˆ†è¾¨çŽ‡ç»˜åˆ¶äº†æ–‡æ˜Œé±¼æ—©æœŸèƒšèƒŽå‘育全细胞命è¿å›¾è°±ã€æˆä½“文昌鱼å„组织的å•ç»†èƒžåŸºå› è¡¨è¾¾å›¾è°±å’ŒæŸ“色质开放特性图谱;分æžäº†æ–‡æ˜Œé±¼èƒšèƒŽå„谱系分化过程中的基因转录动æ€ï¼›è¿ç”¨è·¨ç‰©ç§çš„æ•´åˆåˆ†æžï¼Œæž„建了文昌鱼胚胎å„谱系分化过程中ä¿å®ˆçš„基因调控网络ã€ü/div>
  一个å—ç²¾åµæ˜¯å¦‚何从 å•ç»†èƒü/a>å‘育ã€åˆ†åŒ–为大é‡ä¸åŒç±»åž‹çš„细胞ã€ç»„织和器官,最终构æˆä¸€ä¸ªå®Œæ•´çš„生命体的,一直是å‘育生物学的基本问题和研究目标。得益于近年æ¥å•ç»†èƒžæµ‹åºæŠ€æœ¯å’Œè®¡ç®—生物学的å‘展,以¡°DNAæ¡å½¢ç ?rdquo;为代表的谱系示踪技术å–得了长足å‘展,例如,å‘育生物学研究利用该技术明确了包括å°é¼ ã€æ–‘马鱼ã€éžæ´²çˆªè›™ä»¥åŠæµ·éž˜ç­‰å¤šç§ç”Ÿç‰©çš„细胞å‘育谱系。文昌鱼是介于无脊椎 动物和脊椎动物之间的过渡型动物,是最原始的脊索动物(Chordate),也是探究脊椎动物起æºå’Œæ¼”化的ç†æƒ³å¯¹è±¡ï¼Œåœ¨æŽ¢ç´¢è„Šç´¢åŠ¨ç‰©ç»†èƒžå‘½è¿å†³å®šä¿å®ˆæœºåˆ¶å’Œè¿›åŒ–å‘育中具有é‡è¦åœ°ä½ã€ü/div>
  近日,由中国科学院昆明动物研究所研究员毛炳宇团队牵头,è”åˆä¸­ç§‘院数学与系统科学研究院研究员张世åŽå›¢é˜Ÿã€åŽ¦é—¨å¤§å­¦æ•™æŽˆæŽå…‰å›¢é˜Ÿã€åŽå¤?a href='//www.sqrdapp.com/news/tag_847.html' class='zdbq' title='基因相关食å“资讯' target='_blank'>基因以åŠç¦å»ºå¸ˆèŒƒå¤§å­¦ç­‰ç§‘研团队,在Cell Reports上,在线å‘表了题为Joint profiling of gene ex pression and chromatin accessibility of amphioxus development at single cell resolution的研究论文。该研究è”åˆSplit-seqå•ç»†èƒžè½¬å½•ç»„测åºï¼ˆsnRNA-seq)和10¡Á Genomicså•ç»†èƒžè¡¨è§‚组测åºï¼ˆscATAC-seq)技术,以å•ç»†èƒžåˆ†è¾¨çŽ‡ç»˜åˆ¶äº†æ–‡æ˜Œé±¼æ—©æœŸèƒšèƒŽå‘育全细胞命è¿å›¾è°±ã€æˆä½“文昌鱼å„组织的å•ç»†èƒžåŸºå› è¡¨è¾¾å›¾è°±å’ŒæŸ“色质开放特性图谱;分æžäº†æ–‡æ˜Œé±¼èƒšèƒŽå„谱系分化过程中的基因转录动æ€ï¼›è¿ç”¨è·¨ç‰©ç§çš„æ•´åˆåˆ†æžï¼Œæž„建了文昌鱼胚胎å„谱系分化过程中ä¿å®ˆçš„基因调控网络ã€ü/div>
  该研究检测了ä¸åŒèƒšèƒŽå‘育时期的文昌鱼胚胎,超过å万个细胞的转录组测åºï¼Œå¹¶ç³»ç»Ÿæ€§åœ°ç»˜åˆ¶äº†æ–‡æ˜Œé±¼å„胚层细胞分化路径以åŠæ¯ä¸ªè·¯å¾„中基因的表达å˜åŒ–。åŒæ—¶ï¼Œè¯¥ç ”究进行了æ¥è‡ªä¸åŒèƒšèƒŽå‘育时期的文昌鱼胚胎的å•ç»†èƒžè¡¨è§‚组测åºï¼ŒèŽ·å¾—数万个å•ç»†èƒžçš„表观组数æ®ï¼›é€šè¿‡è½¬å½•ç»„和表观组的整åˆåˆ†æžï¼Œæž„建了文昌鱼胚胎谱系分化过程中的基因调控网络,计算筛选并通过原ä½æ‚交实验验è¯åˆ°å¤šä¸ªç»„织特异表达的新标记基因。该研究构建第一张文昌鱼胚胎å‘育过程中的å•ç»†èƒžåˆ†è¾¨çŽ‡å…¨ç»†èƒžå‘½è¿å›¾è°±ï¼Œäº§ç”Ÿçš„æ•°æ®å¯¹äºŽå‰–æžè„Šæ¤ŽåŠ¨ç‰©å„组织器官的演化具有é‡è¦æ„义ã€ü/div>
  研究工作得到国家自然科学基金ã€ä¸­ç§‘院战略性先导科技专项ã€ä¸­ç§‘院é’年创新促进会与昆明动物所é—传资æºä¸Žè¿›åŒ–国家é‡ç‚¹å®žéªŒå®¤å¼€æ”¾è¯¾é¢˜ç­‰çš„支æŒã€ü/div>
日期9üa href="//www.sqrdapp.com/news/2022-07-06.html">2022-07-06
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