中国科学院东北地理所在大豆对线虫抗性研究中取得进展

　　三代全长转录组测序技术相比二代测序技术，无需打断，可直接读取全长RNA分子全长序列，准确辨别二代测序技术无法准确识别的如可变剪接（AS）、可变多聚腺苷酸化（APA）、融合基因、长链非编码RNA（lncRNA）等结构，并且可同时对基因和转录本进行定量分析等优点。通过对接�?天的大豆种质09-138进行全长转录组测序及分析，共获得6.1 GB的clean data�?5,038个转录本序列；转录本去冗余后鉴定得到1117个新基因�?1,096个新转录本；进一步对新转录本的序列结构进行分析，发现不亲和抗性反应比亲和性反应产生更�?gt;10-PolyA位点（APA）和更多得融合基因，lncRNA和防御反应有关的转录因子相关联，AS�?���?��剪接位点数量接种后都发生变化，说明这些结构变异参与了线虫的抗感反应。差异表达基因（DEGs）的GO（Gene Oncology）和代谢通路KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）分析结果显示抗感线虫侵染后富集于生长激素、生长素激活信号通路和多维细胞生长通路以及苯丙烷生物合成通路；在非亲和反应中发现更多的与应激反应元件（图2）、植物激素信号转导途径和植�?病原菌互作途径相关的DEGs上调表达，而在亲和性反应中检测到更多与细胞壁修饰和碳水化合物生物过程相关的上调基因表达；结合DEGs的蛋白质-蛋白质互作分析首次发现线虫侵染大豆根部后只有不亲和反应激起激酶MAPK/KK/KKK、转录因子WRKY和钙调蛋白VQ之间互作参与抗性防御调控。研究获得的AS、APA和lncRNA为植�?线虫相互作用过程中转录后修饰的功能研究提供理论基础，并且大豆与大豆孢囊线虫间亲和性和非亲和性互作的分子机制将有助于解析其他植物与线虫互作的分子机理，进一步的功能研究将有助于探索线虫防治的新策略、�/div>