客户端
食品晚九点
国际食品
最新搜索:
 
 
当前位置: 首页 » 食品资讯 » 食品科技 » 西北农林科技大学动科学院姜雨教授科研取得新进展

西北农林科技大学动科学院姜雨教授科研取得新进展

放大字体  缩小字体 时间:2021-04-20 13:12 来源:西北农林科技大学 作者: 胡巧娟   原文:
核心提示: 4月9日,西北农林科技大学动科学院姜雨教授团队在《Journal of Genetics and Genomics》发表论文,发布了国际上首个同时整合古代、现代和野生近源物种的基因组资源构建的山羊遗传变异数据库。
  4月9日,西北农林科技大学动科学院姜雨教授团队在《Journal of Genetics and Genomics》发表题为“GGVD: a goat genome variation database for tracking the dynamic evolutionary process of selective signatures and ancient introgressions”论文,发布了国际上首个同时整合古代、现代和野生近源物种的基因组资源构建的山羊遗传变异数据库。博士后付玮玮为第一作者,姜雨教授为通讯作者。
 
  山羊遗传变异数据库 (GGVD) 内容和构建流程 (上) 以及COL4A4基因渗入示例 (下)
 
  目前,已有大量古代和现代家山羊及其野生近源种的基因组信息,为解析山羊的适应性渗入,挖掘群体和品种受选择的功能基因,追溯关键基因的演化历史提供了契机。该研究通过收集这些资源,经过分析和处理,为用户提供了7个功能模块,分别为:1.“基因组选择信号”检索;2.“渗入区间”浏览;3.“变异”检索;4. 基因组浏览器;5. 比对工具(BLAT/BLAST);6. 基因组坐标转换工具(liftOver);7. 基因组选择信号扫描工具(pcadapt)。用户可以输入基因名、基因组区间或位点,以曼哈顿图或折线图查看受选区,以地图映射的方式可视化变异在不同分组中的频率,或通过基因型热图追溯变异位点的时空分布状态,鉴定可能的渗入来源。使用该数据库可以大幅度提高解析山羊演化历史、筛选功能基因和功能位点的效率,从而为分子育种奠定基础。
 
  该研究还列举了一系列基因来阐述数据库的功能。例如,除先前报道的来自“西高加索tur”的野羊渗入基因MUC6外,还发现与阿米巴病相关的COL4A4基因与山羊驯化有关。通过数据检索和可视化,发现COL4A4基因的渗入来源为伊比利亚野山羊支系,至少在8100年前的欧洲羊中就已存在。该结果为基因渗入在山羊驯化过程中发挥的作用提供了另一个范例。
 
  原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1673852721000801?via%3Dihub
日期:2021-04-20
 
 行业: 转基因食品 畜禽肉品 食品检测
 标签: 山羊 基因
 科普: 山羊 基因
 
[ 食品资讯搜索 ]  [ 加入收藏 ]  [ 告诉好友 ]  [ 打印本文 ]  [ 关闭窗口 ]

 

 
 
行业相关食品资讯
 
会展动态MORE +
 
推荐图文
按字母检索 A | B | C | D | E | F | G | H | I | J | K | L | M | N | O | P | Q | R | S | T | U | V | W | X | Y | Z
食品伙伴网资讯部  电话:0535-2122172  传真:0535-2129828   邮箱:news@www.sqrdapp.com   QQ:点击这里给我发消息
鲁公网安备 37060202000128号
 
Baidu
map