中国热科院发布西番莲染色体级别精细基因组

　　近日，中国热科院海口实验站西番莲育种高效栽培研究团队在西番莲染色体级别基因组解析和风味物质合成机理研究方面取得重要进展。

 

　　研究团队利用Illumina、Nanopore、Hi-C测序，采用NextDenovo + SMARTdenovo + NextPolish策略组装，获得~1341.7 Mb的基因组，经与其它19种近缘植物基因家族比较分析，发现西番莲与大戟科（蓖麻，橡胶树和木薯）亲缘关系最密切，发布西番莲染色体级别基因组，明确百香果的进化地位；此外，从基因组、转录组和代谢组等多组学角度挖掘了影响西番莲风味的潜在基因和基因家族，明确α-亚麻酸代谢、代谢途径和次生代谢途径是参与西番莲风味形成过程中重要挥发性有机物（VOCs）合成的主要途径，为西番莲的改良栽培提供宝贵的资源。

 

　　该项工作相关研究结果，以题为：“Chromosome-scale genome assembly provides insights into the evolution and flavor synthesis of passion fruit （Passiflora edulis Sims） ”在中科院JCR一区的TOP期刊《Horticulture Research》发表。中国热科院海口实验站黄东梅助理研究员、海南大学夏志强副教授、齐鲁工业大学张圣奎博士为共同第一作者，中国热科院海口实验站宋顺副研究员、詹儒林研究员为通讯作者。该项工作得到了中国热带农业科学院专项资金支持。

 

　　文章链接：https://www.nature.com/articles/s41438-020-00455-1