华中农业大学园艺植物生物?/a>教育部重炸a href='//www.sqrdapp.com/news/tag_4793.html' class='zdbq' title='实验相关食品资讯' target='_blank'>实验宣a href='//www.sqrdapp.com/news/tag_437.html' class='zdbq' title='番茄相关食品资讯' target='_blank'>番茄团队在New Phytologist发表题为GREEN STRIPE, encoding methylated TOMATO AGAMOUS‐LIKE 1, regulates chloroplast development and chlorophyll synthesis in fruit的研究论文,克隆了番茄果实颜色GS基因位点,揭示了转录因子TAGL1调控番茄果实颜色形成的分子机理、/span>
园艺果实色彩斑斓是由于叶绿素和类胡萝卜素等色素多样性积累。番茄果实表面不均匀分布使得番茄产生条斑表型,在番茄绿熟阶段,叶绿素在果实表面差异性积累,进而绿熟期果实表面呈现绿条斑和浅绿条斑随机分布;红熟阶段番茄果实表面条斑产生,是由于果实表面类胡萝卜素不同组分及其含量差异性。色素在园艺植物果实表面差异性分布是一种普遍存在的现象,比如西瓜、梨、桃和苹果。前人通过反向遗传学方法,揭示了苹果表皮上红条斑和黄条斑产生是由于MYB10启动子甲基化差异导致其表达量差异,伴随着花青苷合成相关基因表达量发生变化,最终苹果表皮上花青苷差异性积累产生红条斑和黄条斑。同样的,前人解析了梨表皮红斑点和条纹也是由于MYB10启动子甲基化差异,目前这种基于甲基化差异的分子调控机理尚未完全清晰、/span>
该研究中,通过?15份番茄核心种质资源性状调查,其?份材料果实表现为条斑表型,因此条斑性状属于稀有变异,在目前育种材料中保存下来。研究团队通过全基因组关联分析(GWAS)结合连锁群体图位克隆的方法,运用表达分析和转基因等分子生物学技术,克隆并鉴定了TAGL1基因调控番茄条斑的形成。通过GWAS分析,与条斑表型相关的显著性主效SNP位于SL2.50ch07_63842838 (P=2.672960472e-256),落在TAGL1的第二内含子中。通过F1表型和F2连锁群体分离比统计,表明番茄条斑表型为隐性性状,是由单基因控制。利用图位克隆,将目标基因锁定在M63825和M63919两个标记之间,两标记物理距离大约93-Kb,有11个基因,11个基因表达量测定表明有且只有TAGL1在浅绿条斑中表达量显著性高于绿条斑。在条斑突变体gs中,利用转基因技术获得TAGL1超量转基因系和敲除系的果实都表现为无条斑表型。在绿熟阶段,相比对照gs,超量系果实表皮中叶绿素含量显著性减少,敲除系果实表皮中叶绿素含量显著性增加,这与TAGL1在浅绿条斑和绿条斑中的差异性表达相吻合。通过RNA-Seq、ChIP-Seq和双荧光素酶实验表明,TAGL1影响叶绿素合成及叶绿体发育相关基因的表达。在7份商业番茄品种及LA3530(AC背景,果实表现为条斑表型)对SNP(SL2.50ch07_63842838)分析,表明此SNP与条斑性状紧密连锁,暗示着甲基化这种表观修饰是由DNA水平上序列差异引起的。在浅绿条斑和绿条斑中进行小RNA的高通量测序,从TAGL1的第二内含子中MITE转录出来的siRNA在绿条斑中表达高于浅绿条斑,此siRNA可能参与影响TAGL1启动子甲基化、/span>
在条斑番茄品种中,TAGL1仅在果实表达差异性表达,产生了条斑的表型,丰富了番茄果实颜色类型。针对保守的SNP,研究团队开发了标记,可以用于分子标记辅助选择育种。华中农业大学番茄课题组的博士研究生刘根忠为本文第一作者,张余洋教授为通讯作者、/span>