1. 合理调整设施标准：为了使经营者可以根据生产工厂的特性，决定不同的温度、湿度调节方式，提供了豁免协作设施安装义务的举例，明确规定照明的最小亮度及工序之间的设施布局等相关用语。
2. 制定GMP适用企业的临时评估依据：在调查、评估GMP适用情况时，可以在不事先通知的情况下随时实施调查、评估。在对违法企业进行调查、评估时，可以进行定期调查、评估和另外的临时评估。在对HACCP适用企业进行GMP评估时，可以与HACCP的联合评估或评估结果。
3. 制定为了取得健康功能食品生产许可，进行GMP评估的程序、方法及划分评估表：为了取得健康功能食品生产许可而进行GMP评估时，使用单独的评估表，进行是否具备优秀设施及参考线等GMP运营基础和运行能力的评估，在该企业可以生产健康功能食品后，增加GMP运营、管理评估，制定相关程序。
4. 在定期复审依据条款中删除《行政管制基本法》。
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