一是创新自查机制，推动主体责任有效落实。在国内率先研究出台《南通市食用农产品集中交易市场食品安全自查指南》，对自查内容、自查频次、报告整改等要求予以明确。研究制定食用农产品集中交易市场、快检室标准化管理台账，夯实食用农产品集中交易市场落实主体责任的基础。实施食用农产品批发市场提质工程，健全食品安全管理人员约谈、培训考核机制，推动各地批发市场对入场销售者电子化建档率达到100%。
二是创新监管机制，实施科学化标准化监管。在省内率先研究出台《南通市食用农产品市场销售日常监督检查指南》，制定食用农产品市场开办方、销售者、贮存者“三张检查表”，为食用农产品市场销售质量安全的标准化、科学化、规范化监管，健全完善食用农产品市场销售质量安全信用管理奠定基础。
三是创新快检机制，构建完善风险防控体系。建立食用农产品批发市场快检、农贸市场快检、监管部门快检、监督抽检“四位一体”食用农产品质量安全检测体系。完善食品安全快检工作机制，依托市快检中心，进一步建立健全全市快检数据抽查比对机制、快检室督查通报机制、快检大数据分析与预警机制、快检负责人约谈与操作人员培训机制。以问题为导向、以快检为抓手，开展风险监测分析研判，全面提升快检工作的覆盖面、时效性、靶向性和科学性。
四是创新追溯机制，实施全过程全链条监管。在全省率先试行“一票通”溯源管理制度，统一食用农产品“一票通”格式，完善并推广使用电子“一票通”平台，在食用农产品生产、批发、销售、消费环节出具、索取、查验、留存“一票通”，完善下游倒逼机制，实现准出准入有效衔接，确保源头安全、环环相扣、道道把关，实现食用农产品来源可溯、流向可查，构筑完善食用农产品销售全环节“追溯”体系。
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