食品科学与工程专业是生物与食品工程系本科专业之一，其前身为蚌埠食品工业专科学校食品工程专科专业，于1984年建校，当年招收食品工程专业专科学生。1989年蚌埠食品工业专科学校与蚌埠联合大学合并组建蚌埠高等专科学校，原蚌埠食品工业专科学校整建制划入，继续招收食品工程专科学生。2004年蚌埠高等专科学校、蚌埠教育学院、蚌埠职工大学三校合并筹建蚌埠学院，在充分调研、考察的基础上，申请设置了食品科学与工程本科专业，当年挂靠原安徽工程科技学院（现安徽工程大学）开始招收食品科学与工程专业本科生。2007年3月经教育部批准蚌埠学院正式建校，考虑到社会需要、办学历史和办学条件，于当年9月开始招收第一届食品科学与工程专业本科生。
食品科学与工程专业现拥有生物化学实验室、微生物学实验室、食品分析实验室、食品工艺学实验室、分子生物学实验室、酶工程实验室、天然产物提取分离实验室、食品化学实验室、啤酒工艺实验室、发酵工艺实验室、分析测试中心等11个实验室，实验室总面积3200平方米，现有仪器设备总数706台（件），总值约600万元，其中万元以上仪器设备共125台（件），能够基本满足本学科实践教学科研需要。
食品科学与工程专业现有专业教师20人，其中教授2人，副教授8人，讲师10 人；具有博士学位5人，硕士学位7人，另有专职实验员3人，其中高级实验师1人。师资队伍有安徽省学科拔尖人才1 人，安徽省“教坛新秀”2人，蚌埠市“优秀教师”1人，蚌埠学院首届教学名师1人，蚌埠学院中青年学科带头人3人，蚌埠学院中青年骨干教师6人。
近五年来，食品科学与工程专业教师共承担各类科研项目38项，其中安徽省教育厅自然科学研究项目15项，院级项目6项，产学研合作项目17项。承担省级和院级教学改革项目13项。发表论文140余篇，其中SCI收录5篇，EI收录6篇，编写教材5部，申请国家发明专利6项。蚌埠市科技进步三等奖1项。
本专业教师已承担安徽省教育厅教研项目3项、省级本科精品课程1门、院级教研立项7项，院级重点课程2门；获得院级教学成果一等奖1项、二等奖1项、三等奖2项；6名教师在学院理论及实践教学竞赛中获奖。
