在传统工业啤酒的基础上调整发酵时间、人工酿造缩减生产规模，精酿啤酒更大的优势为啤酒酿造材料的灵活运用。水果型精酿啤酒、功能型精酿啤酒常在啤酒酿造过程中加入特定食材、药材、香辛料等添加物，以达到期待的啤酒风味或健康增效，这也是精酿啤酒最大的特色。

水果应用于啤酒酿造中，可以赋予啤酒令人愉悦的果香，丰富酒体口感，提供适当的甜度与酸度，同时其功能活性成分部分保留，成为啤酒的附加属性。由于大多数水果有香气怡人、糖分大等特点，在酿造过程中加入水果是诸多精酿啤酒的选择。如荔枝，香气浓郁，其含有的风味成分可以赋予成品荔枝啤酒香甜的特征，所含的维生素有增强啤酒抗氧化功能属性。柠檬可以增加啤酒中的维生素C含量，促进人体新陈代谢。有多种水果复合香气的百香果，味酸甜，其含有的舒缓神经的天然活性成分，可能改善饮酒引起的不适。石榴所富含的花色苷和酚类化合物，为石榴啤酒提供鲜艳的色泽。水蜜桃包含多种果糖、维生素等营养物质，可以为啤酒增添甜味。

许多植物的花带有特殊芬芳且具有可食用的属性，以合适的方式将其加入啤酒酿造可以得到花香酒香并存的精酿啤酒。与此同时酒体中能够增加部分外来有益成分，口感也更加丰富。具有特殊香气的板栗花，味微苦、带涩味。其中的黄酮类化合物对枯草芽孢杆菌、大肠杆菌具有抑菌作用，因此板栗花啤酒的保鲜与储存较为方便，同时安全性得到保障。味辛性温气香的桂花，兼具食用和药用价值。作为辅料生产桂花啤酒，既能为啤酒提供桂花香气，又能提供苦涩口感，减少酒体中残糖带来的腻感。

香辛料通常带有鲜明又独特的气味，可被用作啤酒酿造的辅料来使用，能够赋予酒体特殊的风格，形成新鲜特别的滋味。性温且微苦的橘皮富含纤维素、半纤维素等物质，可为啤酒增添橘香、减少酒体中残糖导致的甜腻口感。其所含的橙皮苷作为维生素类物质，具有增强毛细血管韧性的功效，同时兼有杀菌、抗炎的作用。芫荽籽，即香菜的成熟果实，含有较多的胡萝卜素和铁元素，可与其他辅料配合使用来酿造啤酒。在酒精发酵过程中，姜所含的姜辣素等生物活性成分为啤酒提供辛辣口感。

值得注意，随着人们对健康的日益关注，药食同源辅料在啤酒生产中也逐步加入。藜麦具有全面又丰富的营养，其含有的藜麦芦丁可预防各种血细胞在血管中凝集，改善心血管功能，同时因其高淀粉含量而作为部分酿酒大麦的替代品。